博士研究生

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微软学者奖

  首   届 (1999年)       周志华
  第二届 (2000年)       杨凡
  第三届 (2001年)       苏丰
  第四届 (2002年)       姜远
  第五届 (2003年)       裴玉
  第六届 (2004年)       张敏灵
  第七届 (2005年)       黎铭
  第九届 (2007年)       刘胥影 俞扬
  第十一届 (2009年)    李宇峰 王巍

全国优秀博士论文

  周志华  2003
  宋继强  2004

中国计算机学会优秀博士论文（2006年首届）

  黎   铭  2009
  张敏灵  2008

江苏省优秀博士论文

  张敏灵  2009
  谭晓阳  2007
  马晓星  2005

南京大学优秀博士学位论文

  刘   明  2008
  谭晓阳  2007
  路   通  2006